Yo tengo un pebble y un iPhone 6, con iOS, a la última versión a día de hoy 8.3 y todas las notificaciones funcionan sin problema, llamadas, watssapp, mail.. Etc, cualquier notificación de cualquier aplicación me aparece en el pebble.
Comprueba tu conexión bluetooth, si no es conexión LE, solo llegan las llamadas...
Con un iPhone 5 me paso, que hasta que el pebble no pidió conexión al teléfono, no se emparejó bien , y solo me llegaban las llamadas, en cuanto pidió conexión y me salió el mensaje en el iPhone y la acepte, empezó a funcionar todo de forma correcta...
Llevo desde febrero con el, y no he tenido ningún problema ( a parte de uno al actualizar iOS, pero se soluciono gracias a una actualización por parte de pebble)... Mínimo 5 días de batería y todo perfecto.