Yo en la actualizacion de ayer 6 de Mayo a la 2.1 en el reloj y a la 2.1.3 en el iPhone tambien me pasa lo del mensaje que no estan configuradas las notificaciones, aunque el reloj funciona perfecto.
He restaurado valores de fabrica en el reloj, desemparejado el BT en el iPhone, reinstalado la aplicacion... Y sigue ahi. Aunque mientras funcione, tampoco es importante.