En realidad, eso no es un problema de Pebble en sí, me explico, es whatsapp quien debe crear la aplicación en el Pebble y no lo ha hecho, lo que hay, con éxito relativo, son aplicaciones creadas por usuarios, con las limitaciones que eso conlleva. Si te sirve de referencia acerca de lo poco interesada que está whatsapp en estos temas, para el Apple Watch no existe whatsapp , puedes responder, igual que con el Pebble , pero no puedes acceder a la aplicación en si en el reloj, como con telegram que sí ha hecho sus deberes ( hasta cierto punto) , porque no existe.
Dudo mucho que haya una solución a corto / medio plazo, no sé si en el panorama de android wear ocurre lo mismo.