Las alarmas las tenía configuradas en el reloj directamente, así me evitaba que el modo "no molestar" o similar en android afectase el que sonase la alarma o si se me olvidaba poner a cargar el móvil y este se apagara por falta de batería.
En el caso de las notificaciones de calendario, si usas la cuenta de gmail, comprueba que la App de Pebble tiene los permisos necesarios o si en el centro de notificaciones de la App de Pebble están activadas estas notificaciones en concreto.